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快速發展的蛋白降解技術被認為可以抑制“不可被靶向”的蛋白分子,有望成為抑制KRAS蛋白的利器。PROTAC (proteolysis targeting chimera) 這種雙功能分子的一頭結合目標蛋白,通過鏈結與另一端結合E3泛素連接酶的砌塊,從而使兩者靠近,介導目標蛋白的多泛素化和降解。然而,想要使用PROTAC降解KRAS蛋白,人們還要找到KRAS的高親和力配體。由于蛋白表面沒有明顯的結合口袋,想要找到非共價的KRAS配體是非常困難的。另外,還要鑒定出有效招募E3連接酶的片段也相當不容易。
為了解決上述的難題,晶銳醫藥(蘇州)有限公司開發了一系列靶向KRAS G12D蛋白的高活性小分子化合物, 隨后篩選出了多個Linkers及多個相關的E3連接酶的片段,其中E3連接酶VHL (von Hippel–Lindau protein) 在胰腺癌細胞株SW1990和AsPC-1均有表達。兩種細胞株表達純合KRAS G12D基因。我們已經開發了許多針對KRAS G12D的PROTAC小分子化合物,并且已經成功地降解了細胞體內的KRAS G12D蛋白(SW1990, ASPC-1等),IC50濃度達到納摩爾水平(部分結果如下圖所示JR-Protac-2、JR-Protac-3)。
KRAS在胰腺癌中發生比例最高,而胰腺癌又俗稱“癌中之王”,本身治療手段有限。相較于KRAS G12C主要集中在肺癌領域,KRAS G12D的優勢領域聚焦在胰腺癌。區別于KRAS G12C在肺癌領域的發生比例,KRAS G12D在胰腺癌中高出了一個數量級,更加說明開發KRAS G12D抑制劑或者降解劑的緊迫性。